Trichology

Réduction des gènes de résistance aux antibiotiques dans le microbiote intestinal des patients ayant une infection récurrente à Clostridium difficile après une transplantation fécale de microbiote

Au rédacteur en chef-Nous lisons avec grand intérêt le récent rapport de Millan et al étudiant les gènes ABR de résistance aux antibiotiques dans le microbiote des patients après une transplantation réussie de microflore fécale. Traitement FMT de l’infection récurrente à Clostridium difficile rCDI Les auteurs rapportent une réduction du nombre et de la diversité des L’analyse a été réalisée en utilisant le séquençage métagénomique et la biopuce ADN ciblant les gènes ABR Dans notre étude, nous avons déterminé la présence de gènes ABR dans les échantillons fécaux de donneurs et de donneurs. patients traités avec FMT pour le rCDI Nous avons utilisé la réaction en chaîne de la polymérase quantitative qPCR array pour les gènes ABR ADN microbien qPCR Array pour les gènes de résistance aux antibiotiques, Qiagen et les gènes trouvés dans tous les échantillons Les gènes détectés appartenaient à différentes classes de résistance: β-lactamines et gènes de résistance aux bêta-lactamines, fluoroquinolone, macrolide, lincosamide et streptogramine, aminogl Comme pour Millan et al, nous avons observé une réduction du nombre et de la diversité des gènes ABR dans les échantillons des patients prélevés ou des mois après la FMT par rapport aux échantillons antérieurs à la FMT. malgré le fait que moins de gènes ABR sont inclus dans notre tableau que dans Millan et al. Ainsi, nos résultats confirment les découvertes récentes de Millan et al dans un groupe indépendant de patients.

Figure Vue largeDownload slideLes nombres de gènes ABR de résistance aux antibiotiques A et le nombre de gènes uniques et partagés B dans les échantillons fécaux des donneurs n = et les patients n = avant et après la transplantation de microflore fécale pré-FMT et post-FMT respectivement pour Clostridium difficile récidivante infection Le graphique en boîte montre les médianes et quartiles et dans les boîtes et les nombres minimum et maximum de gènes ABR dans les groupes étudiés dans les moustaches. Le test t de Student a été utilisé pour évaluer la signification statistique entre les patients pré- et post-FMT. nombre de gènes ABR de résistance aux antibiotiques A et nombre de gènes uniques et partagés B dans les échantillons fécaux des donneurs n = et patients n = avant et après la transplantation de microflore fécale pré-FMT et post-FMT respectivement pour l’infection récurrente à Clostridium difficile les médianes et quartiles et dans les boîtes et les nombres minimum et maximum de gènes ABR dans les groupes étudiés dans wh Le test t de Student a été utilisé pour évaluer la signification statistique entre les données pré- et post-FMT normalement distribuées. Le TMT est un traitement efficace du rCDI, avec un taux de récupération de +%. FMT restaure la composition normale et la diversité du microbiote. Le FMT est considéré pour d’autres indications en raison de son efficacité dans la modification du microbiote intestinal. Nous sommes d’accord avec la suggestion de Millan et al. d’utiliser la FMT comme option de traitement. éradiquer les bactéries multirésistantes des patients Cependant, il faut reconnaître que si la FMT réduit les gènes ABR chez les patients, elle peut aussi introduire de nouvelles résistances dans le microbiote des patients. Nous avons observé un transfert possible de résistance par FMT; le gène de résistance vanB a été trouvé chez tous les donneurs et chez tous les patients post-FMT, mais pas pré-FMT. Le transfert de gènes ABR non pathogènes, y compris le transfert non-encéphalique de vanB, pourrait être un scénario courant dans le FMT. donneurs et adultes en bonne santé En ce qui concerne vanB, le gène est généralement présent dans différentes espèces intestinales comme les espèces Clostridium, Ruminococcus et Eggerthella et même dans les lactobacilles de qualité alimentaire , et jusqu’à% des adultes de la communauté ont été trouvés. Cependant, nos résultats appellent à une amélioration des programmes de dépistage des donneurs en tenant compte des gènes ABR L’importance d’un dépistage plus approfondi des donneurs est également soulignée par l’observation récente que les souches de donneurs transférées dans la FMT persistent pendant des mois . l’utilisation accrue de la FMT, les procédures de dépistage des donneurs doivent être constamment améliorées

Remarques

Soutien financier Ce travail a été soutenu par les numéros de subvention de l’Académie de Finlande et Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: Aucun conflit signalé Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits potentiels de conflits d’intérêts que les éditeurs considèrent pertinents au contenu du manuscrit ont été divulgués