Infirmière

Origine et caractéristiques moléculaires d’un nouveau virus de l’influenza aviaire à virus AHN responsable de l’infection humaine à Taiwan

Au mois de mai, le premier cas humain de grippe aviaire chez les humains a été signalé à Taïwan. Un nouveau virus de l’influenza AHN d’origine aviaire a été confirmé par le Centre national de la grippe, Centers for Disease Control de Taïwan. Les virus grippaux du sous-type H ont d’abord été identifiés chez les dindons et constituent l’un des sous-types les plus communément reconnus chez les canards domestiques du sud de la Chine Des études antérieures ont montré que le virus HN est faiblement pathogène. Nous avons d’abord mené une analyse de séquence identique en utilisant le nucléotide BLAST pour tous les segments du nouveau virus HN dans les bases de données de séquences du virus de la grippe aviaire GISAID, NCBI Le gène PB de la nouvelle grippe humaine A / Taiwan // HN EPI_ISL_ a la plus forte similarité de séquence nucléotidique avec A / poulet / Taiwan / PF / HN à%, où comme les gènes restants ont montré que la plus haute similarité de séquence nucléotidique A / poulet / Taïwan / A / HN variait de% NA à% NP Nous avons également construit les arbres phylogénétiques de vraisemblance maximale pour chaque segment du génome en utilisant le programme PhyML Les résultats de phylogénétique Les analyses ont montré que tous les gènes de ce virus étaient regroupés dans la lignée taiwanaise. En tenant compte des calendriers de prélèvement, le parent le plus proche de A / Taiwan // HN est A / chicken / Taiwan / A /, suggérant que ce dernier pourrait être le précurseur du virus stress post traumatique. nouveau virus Nos résultats indiquent A / Taïwan // HN a été réassocié de A / poulet / Taïwan // HN PB et PA gènes, A / poulet / Taïwan / A / HN M gène, A / poulet / Taïwan / ch / HN HA gène et A / poulet / Taïwan / TC / HN PB, NP, NA et NS gènes Figure

Figure Vue largeTélécharger Diagramme schématique des origines du nouveau virus de la grippe humaine réassorti AHN Les couleurs des segments de gène dans les ovales indiquent leur origine Les lignes pointillées représentent les différents moments où les séquences les plus proches identifiées à partir des analyses phylogénétiques du nouveau virus HN ont été collectées View largeTélécharger Diagramme schématique des origines du nouveau virus de la grippe humaine réassorti AHN Les couleurs des segments de gène dans les ovales indiquent leur origine Les lignes pointillées représentent les différents moments où les séquences les plus étroitement liées identifiées à partir des analyses phylogénétiques du nouveau virus HN ont été collectées. Nous avons étudié les signatures moléculaires du nouveau virus HN Cent séquences de gènes HA et NA de similarité plus élevée ont été choisies pour l’analyse d’alignement d’acides aminés. Pour HA, la souche A / Taiwan avait une faible pathogénicité car sa région peptidique de liaison HA / HA QIATR / GIF manquait les acides aminés multibases, qui En revanche, la séquence avant le site de clivage dans la plupart des virus de la grippe HN est QIETR ou QIKTR La plupart des sites de mutation étaient dans la partie HA, alors que seuls les changements ont été trouvés dans le Comparaison intéressante avec les virus A / HN du poulet, nous avons trouvé des sites de mutation inhabituels dans la nouvelle numérotation humaine A / HN: PL et ATH, qui se situait près du domaine de la liaison au récepteur HA. H numérotation de ce nouveau HN, la position dans HA était S, comme dans les souches H humaines, ce qui soulève effectivement la possibilité que HN pourrait transmettre aux humains Pour NA, le nouveau virus a montré une suppression de l’acide aminé dans la NA sites de mutation et de mutation: numération SL, GN, KR, VM et DE H La variation de longueur de la tige NA peut affecter la gamme d’hôtes du virus grippal A Nos résultats sur l’origine et les caractéristiques moléculaires du nouveau HN peuvent être utile pour influenz future une surveillance

Remarques

Soutien financier Cette étude a été appuyée par le Laboratoire clé de sécurité environnementale et écologique biotique dans la province d’Anhui, le programme clé de la Fondation des sciences naturelles des établissements d’enseignement supérieur Anhui KJA et la Fondation provinciale des sciences naturelles Anhui MCPotential conflits d’intérêts Tous les auteurs: Non Conflits signalés Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits potentiels de conflits d’intérêts que les éditeurs considèrent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués