Danté dentaire

Mutations du cancer de la prostate identifiées

La carte génétique du cancer de la prostate a été « fissurée », a rapporté le Daily Telegraph. Le journal a déclaré que de nouvelles recherches sur le cancer de la prostate ont fourni une « percée qui pourrait transformer notre compréhension de la maladie ».

La recherche a analysé l’ensemble des séquences génétiques des tumeurs de la prostate et les a comparées à la génétique des cellules saines du même patient. La recherche a identifié une série de mutations et de modèles génétiques qui ont montré comment l’ADN est parfois réarrangé dans ces tumeurs. Les chercheurs suggèrent que ces modèles peuvent être uniques au cancer de la prostate et peuvent jouer un rôle dans son initiation.

Une telle recherche aide à mieux comprendre les raisons génétiques complexes pour lesquelles certains hommes peuvent développer un cancer de la prostate alors que d’autres ne le font pas. Cependant, il faudra un certain temps avant que cette connaissance puisse être utilisée dans le diagnostic ou le traitement car plusieurs milliers de mutations ont été identifiées dans chaque tumeur et on ne sait pas quel effet a chaque mutation. L’étude a également examiné seulement sept tumeurs, donc d’autres recherches doivent vérifier la présence de ces mutations dans plus d’échantillons.

D’où vient l’histoire?

De nombreux chercheurs de plusieurs institutions de recherche à travers les États-Unis ont contribué à cette recherche. L’étude a été financée par plusieurs organisations américaines, dont la campagne Movember de la Prostate Cancer Foundation, le Howard Hughes Medical Institute, l’Institut national de recherche sur le génome humain, la Kohlberg Foundation, le National Cancer Institute et les National Institutes of Health. Il a été publié dans la revue scientifique à comité de lecture Nature.

Les journaux ont généralement rapporté l’étude clairement, bien que le Daily Mail n’a pas souligné que cette étude a des limites en raison du petit nombre d’échantillons testés. Étant donné que la recherche n’a porté que sur des échantillons de sept hommes, elle doit être répétée à plus grande échelle.

De quel type de recherche s’aggissait-t-il?

Cette étude génétique a entrepris de séquencer le code ADN entier des cellules cancéreuses de la prostate. Le cancer de la prostate est une maladie majeure et la deuxième cause la plus fréquente de décès par cancer chez les hommes au Royaume-Uni. Des recherches antérieures, à travers des études d’association à l’échelle du génome, ont montré que certaines variantes à une seule lettre dans le code de l’ADN sont associées à un risque accru de cancer. En fait, neuf de ces variantes ont été identifiées par quatre études couvertes par Behind the Headlines en septembre 2009. Ces études ont conclu que de nombreuses régions de l’ADN semblent contribuer au risque de cancer de la prostate et que d’autres variantes sont susceptibles d’être découvertes.

Les méthodes de cette recherche différaient de celles utilisées dans les études d’association pangénomique, qui examinent les associations pouvant exister entre des variations spécifiques de l’ADN et le risque de développer une maladie particulière. Dans la présente étude, les chercheurs ont «lu» (séquencé) le code génétique complet des cellules cancéreuses de la prostate d’une personne et l’ont comparé à la séquence génétique des cellules prostatiques saines de cette personne. En utilisant cette méthode, les chercheurs ont pu voir quels changements génétiques et mutations se produisaient dans ces cellules au fur et à mesure qu’elles devenaient cancéreuses.

Qu’est-ce que la recherche implique?

Les chercheurs ont utilisé de l’ADN extrait d’échantillons de tumeurs de prostate provenant de sept hommes ayant subi une prostatectomie radicale (ablation de la prostate et des tissus apparentés). Ils ont également eu des échantillons de sang de ces hommes. L’ADN extrait du sang a été utilisé comme témoin dans les expériences, pour montrer à quoi ressemblait l’ADN des hommes dans les cellules non cancéreuses.

Les chercheurs ont séquencé le génome entier des cellules cancéreuses de la prostate, à la recherche de mutations et de variations qui n’existaient pas dans les cellules normales du même patient. Ils ont cherché de petites différences dans la séquence de l’ADN, des changements à plus grande échelle dans les arrangements chromosomiques et des cas où une partie d’un chromosome s’était rompue et attachée à un autre chromosome pour former un hybride. L’ADN a été séquencé en utilisant des méthodes établies dans ce domaine et l’information a été traitée par un logiciel complexe qui a pu identifier la présence de mutations dans l’ADN.

Une partie des mutations détectées ont été vérifiées en utilisant différentes méthodes pour valider le processus original. Les chercheurs ont rapporté combien de mutations ils ont détectées dans les cellules tumorales et leurs observations sur les types communs de réarrangements génétiques eczéma. Ils ont ensuite discuté de la façon dont certaines variations peuvent augmenter le risque de développer un cancer de la prostate.

Quels ont été les résultats de base?

Les chercheurs ont trouvé environ 3 866 mutations du code génétique dans chaque tumeur, un taux de mutation similaire à celui observé avec le cancer du sein et la leucémie myéloïde aiguë, mais inférieur à celui observé dans le cancer du poumon à petites cellules et le cancer de la peau.

Deux des sept tumeurs testées avaient des mutations dans deux gènes appelés SPTA1 et SPOP. Dans trois des sept tumeurs, il y avait des mutations dans trois gènes appelés CHD1, CHD5 et HDAC9, qui sont responsables de la production de protéines modificateurs de la chromatine. Ces protéines jouent un rôle dans la suppression des tumeurs, la régulation de l’activation et de la désactivation des gènes et la capacité des cellules souches à se développer en différentes cellules du corps. Trois des sept tumeurs avaient également des mutations dans HSPA2, HSPA5 et HSP90AB1, un ensemble de gènes liés à la réponse des cellules au stress et aux dommages environnementaux. D’autres gènes ont été mutés dans une seule des sept tumeurs.

Les chercheurs ont identifié 90 réarrangements chromosomiques dans chaque tumeur et ont noté que ce nombre était similaire à celui observé dans les cellules cancéreuses du sein. Les réarrangements ont montré un profil distinctif qui n’aurait pas été vu auparavant dans d’autres tumeurs solides.

Certains des réarrangements impliquaient des gènes qui étaient affectés par des mutations d’une seule lettre dans d’autres tumeurs, y compris le gène CHD1 du modificateur de la chromatine. Un certain nombre de réarrangements se sont également produits près de plusieurs gènes cancéreux connus.

Au total, seize gènes affectés par une mutation réarrangement ont été retrouvés dans au moins deux tumeurs.

Comment les chercheurs ont-ils interprété les résultats?

La découverte de nombreuses mutations dans le code génétique des cancers de la prostate, dont certaines sont associées à des gènes connus, a conduit les chercheurs à conclure que ces mutations peuvent contribuer au développement de tumeurs dans la prostate.

Ils disent également que le nombre élevé de « fusions de gènes récurrentes » suggère que les réarrangements dans l’ADN peuvent être des événements critiques dans l’initiation du cancer de la prostate. Ce sont des réarrangements complexes et les chercheurs notent qu’une «approche du génome entier», qui considère l’ensemble du code génétique d’une cellule tumorale, est nécessaire pour les profiler.

Conclusion

Cette étude importante a examiné la séquence génétique entière dans un échantillon de cellules tumorales de la prostate et l’a comparée à celle d’un tissu normal. Il a révélé qu’il existe de nombreuses mutations et réarrangements de l’ADN, qui, selon les chercheurs, pourraient augmenter le risque de ce type de cancer. Fait important, seulement sept échantillons de tumeurs ont été utilisés dans cette analyse, et les mutations identifiées n’étaient pas présentes dans tous les échantillons de tumeur. Cela confirme ce qui est déjà suspecté sur la maladie, à savoir que les facteurs affectant le cancer de la prostate sont complexes, en particulier les éléments génétiques.

Les méthodes de cette étude devront être reproduites dans un plus grand échantillon de personnes, un processus qui sera probablement long et fastidieux. Une telle recherche devra également confirmer dans quelle mesure chaque mutation ou réarrangement de l’ADN augmente le risque de la maladie et la fonction normale des gènes autour des sites de mutation. Une telle information pourrait être critique dans le développement d’approches de dépistage ou de traitement à l’avenir.

Bien que cette étude ait largement appliqué une approche du génome entier à la compréhension de la génétique du cancer de la prostate, elle doit maintenant être appliquée à davantage d’échantillons. Ce n’est qu’alors que l’on pourra apprécier toutes les implications des changements génétiques découverts grâce à cette recherche.